Совет попечителей — главный управляющий орган АУЦА, который контролирует выполнение миссии и соблюдение ценностей университета. Ведущие отечественные и зарубежные специалисты в области бизнеса, науки и гражданского общества вносят свой вклад в определение стратегических целей АУЦА и поддерживают их реализацию.